首篇文章发表！BGISEQ-500 RNA-Seq，不能错过的还有这些……
厉害了BGISEQ-500平台，
最近迎来文章密集发表期！
继Small RNA文章即将Online
这次RNA-Seq又迎来好消息：
第一篇客户文章正式发表了！
在这里，科技君可以提前透露的是，
接下来还将有越来越多文章陆续发表！
Comparative transcriptome analysis of chemosensory genesin two sister leaf beetles provides insights into chemosensory speciation
两个叶甲姐妹种化学感应基因的比较转录组学分析，揭示化学感应物种形成
期刊名：Insect Biochemistry and Molecular Biology
发表时间：2016年11月9日
单位：中国科学院动物研究所等
文章中使用BGISEQ-500平台做RNA-Seq，研究叶甲姐妹种中化学感应直系同源基因表达水平，用qRT-PCR验证RNA-Seq结果，随机挑了12个验证，验证结果说明BGISEQ-500 RNA-Seq定量准确。
化学感受对于昆虫非常重要，昆虫利用自己的化学感受器识别环境中的化学信号，并产生相应的行为反应。因此昆虫近缘种间化学感应基因的分化产生行为分化，比如食物、产卵地点和交配的偏好，行为分化进而产生交配前生殖隔离。此即为化学感应物种形成。
要查明化学感应基因在物种形成中的作用，其中一个方法是在近缘种之间比较这些基因，来发现分歧进化的遗传特征。本文研究的是一种植食性的昆虫——叶甲，挑选了叶甲两个姐妹种P.aenescens和P. maculicollis。这两个种有生殖隔离和宿主植物偏好，虽然吃一样的宿主植物，但只专门吃特定的株龄。
研究思路
图1 研究思路
叶甲姐妹种P.aenescens吃成树叶子，P. maculicollis吃籽苗叶子，做转录组de novo+BGISEQ-500 RNA-Seq，构建进化树，筛选正选择基因和差异表达基因，从而寻找化学感应物种形成的关键基因。
研究设计
研究发现
1.功能注释发现两个姐妹种的转录组高度相似，整体上是低分歧的，这与预期相符。
2.注释化学感应基因，并进行进化分析，构建maximum likelihood (ML)树，鉴定两个种的化学感应基因直系同源对及了解和其他昆虫的关系。
3.发现一些正选择下高表达和差异表达的化学感应基因在化学引导的生殖隔离和生态隔离中起了关键作用。
BGISEQ-500 RNA-Seq定量准确
文章利用转录组de novo数据做参考序列，BGISEQ-500 RNA-Seq定量化学感应基因表达水平，选取4个P. aenescens和3个P. maculicollis样品做生物重复，研究化学感应直系同源基因表达差异。用qRT-PCR验证RNA-Seq结果，随机挑了12个基因做验证。
表1 显著性差异表达的化学感应物种形成的候选直系同源基因
图2 随机挑选12个直系同源基因，两个种基因表达量倍数比值（P.aenescens/P. macilicollis）的RNA-Seq和qRT-PCR比较
从图中可以看出，BGISEQ-500 RNA-Seq定量结果与qPCR一致性很高。客户文章数据证明了BGISEQ-500 平台定量准确！（点击页面下方“阅读原文”查看文章）
RNA-Seq作为BGISEQ-500 平台推出的第一个产品，在文章发表方面也走在了前头。关于它的作用和优势，您是否全都了解？
01
BGISEQ-500 RNA-Seq的服务领域
对某一物种或特定细胞在某一功能状态下产生的mRNA进行高通量测序，研究基因的表达差异情况，可应用于基础研究、临床研究和药物研发等领域。
02
BGISEQ-500 RNA-Seq推荐方案
03
BGISEQ-500 RNA-Seq数据质量比较
与HiSeq平台相比，BGISEQ-500价格更低，低至999元/样品；周期更短，只需25个工作日。既快捷又便宜的服务，数据质量又如何呢？
科技君为大家展示一下基于BGISEQ-500和HiSeq 4000平台的下机数据的比较，随机挑选了一个植物和动物样本，可以看到BGISEQ-500平台和HiSeq 4000平台的一致性很好。
图3 （左）BGISEQ-500与HiSeq平台表达量一致性>0.96，（右）>95%鉴定到的基因与HiSeq平台一致
图4 （左）BGISEQ-500与与HiSeq平台表达量一致性>0.95，（右）>93%鉴定到的基因与HiSeq平台一致
04
BGISEQ-500平台都有哪些产品推出？
短短几个月时间，就有2篇客户发表的BGISEQ-500文章，简直就是拿了项目结果写文章，文章一投稿就发表的节奏哇。
文章发表是展示科研成果的重要手段，在此衷心祝贺各位老师，也特别感谢老师们的信任，未来BGISEQ-500平台还将不断推出更多产品，持续为大家带来更好的服务！
还有一个好消息告诉大家，BGISEQ-500 RNA-Seq促销活动继续！
买10送10，买5送3
每个样本最低价格仅需999元
20M clean reads/样本，包含信息分析
如果您有任何疑问，欢迎留言给科技君，或咨询当地科技代表，当然也可以通过如下方式联系我们：
电话：400-706-6615
邮箱：info@bgitechsolutions.com
网站：www.bgitechsolutions.com
地址：深圳市盐田区洪安三街21号华大综合园7栋，518083
*最终解释权归深圳华大基因股份有限公司所有。
撰稿：赵青、王艳
编辑：市场部
猜你喜欢
大国重器 | BGISEQ-500 RNA-Seq 样本数3个月破8000！
请继续关注“BGI华大科技”公众号，
科技君将一如既往地为您提供精彩内容！
如有相关问题，欢迎后台留言~~
▼
关注华大科技，尽享精彩科研！